Причина в том, что Outlook.com / Hotmail не поддерживают почтовый протокол IMAP (который дает доступ к папкам, и который поддерживают практически все остальные почтовые сервисы). Поэтому программа подключается по протоколу POP3, а он не поддерживает папок.
Поддержку IMAP обещали прошлым (2012) августом, сейчас апрель, новостей о реализации пока не видел.