StR спасибо за ответ, но данная информация мне не помогла.
Когда я захожу в "Другие папки..." мне видны только те папки, которые были в почтовом ящике по умолчанию - Deleted, Drafts, Junk, Outbox и т.п. Папки которые я создавал сам не видны. В меню выбора способа синхронизации папок та же история (Доп. настройки и папки -> Папки).
Причём созданные мной папки программа не видит именно в почтовом ящике live.com. В других подключённых ящиках inbox.lv, yandex.ru, mail.ru и корпоративной Exchange почте таких проблем нет, и там я вижу абсолютно все созданные мной папки.
Ящик live.com подключал через пункт Добавить учётную запись -> Hotmail и Outlook.com, я так понимаю это одно и тоже.